Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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