Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO4P61968 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO4P61968 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO4P61968 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO4P61968 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO4P61968 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO4P61968 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO4P61968 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO4P61968 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO4P61968 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO4P61968 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO4P61968 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms