Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA9P57773 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA9P57773 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA9P57773 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA9P57773 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA9P57773 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA9P57773 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA9P57773 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA9P57773 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA9P57773 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA9P57773 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA9P57773 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA9P57773 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA9P57773 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA9P57773 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA9P57773 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA9P57773 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms