Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms