Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLCSP50747 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLCSP50747 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLCSP50747 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLCSP50747 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLCSP50747 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLCSP50747 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLCSP50747 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLCSP50747 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLCSP50747 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms