Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLK1P49759 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLK1P49759 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLK1P49759 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLK1P49759 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms