Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTAP49354 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTAP49354 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTAP49354 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTAP49354 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTAP49354 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTAP49354 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTAP49354 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FNTAP49354 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FNTAP49354 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FNTAP49354 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTAP49354 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTAP49354 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTAP49354 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FNTAP49354 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FNTAP49354 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms