Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC19A1P41440 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC19A1P41440 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms