Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA13P31271 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA13P31271 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms