Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCHP24723 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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PRKCHP24723 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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PRKCHP24723 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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PRKCHP24723 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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PRKCHP24723 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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PRKCHP24723 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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PRKCHP24723 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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PRKCHP24723 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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PRKCHP24723 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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PRKCHP24723 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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