Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD247P20963 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD247P20963 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD247P20963 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms