Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms