Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIG1P18858 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIG1P18858 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIG1P18858 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIG1P18858 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LIG1P18858 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LIG1P18858 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LIG1P18858 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms