Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SPI1P17947 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SPI1P17947 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SPI1P17947 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SPI1P17947 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPI1P17947 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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