Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 SUGT1P3-205ENST00000633814 572 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms