Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IGKV1-13P0DP09 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms