Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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