Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNP07948 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNP07948 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNP07948 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNP07948 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNP07948 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNP07948 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LYNP07948 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYNP07948 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYNP07948 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYNP07948 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYNP07948 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYNP07948 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYNP07948 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYNP07948 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LYNP07948 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYNP07948 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYNP07948 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYNP07948 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYNP07948 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYNP07948 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYNP07948 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYNP07948 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms