Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLK3P07288 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLK3P07288 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLK3P07288 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms