Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN1SWP03999 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms