Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CLDN9O95484 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CLDN9O95484 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CLDN9O95484 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CLDN9O95484 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CLDN9O95484 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CLDN9O95484 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CLDN9O95484 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CLDN9O95484 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN9O95484 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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