Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CYTIPO60759 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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CYTIPO60759 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CYTIPO60759 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CYTIPO60759 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CYTIPO60759 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CYTIPO60759 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CYTIPO60759 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CYTIPO60759 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CYTIPO60759 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CYTIPO60759 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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