Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms