Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP290O15078 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP290O15078 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP290O15078 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP290O15078 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP290O15078 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP290O15078 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP290O15078 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP290O15078 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP290O15078 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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CEP290O15078 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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CEP290O15078 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP290O15078 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP290O15078 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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CEP290O15078 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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CEP290O15078 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP290O15078 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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CEP290O15078 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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CEP290O15078 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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CEP290O15078 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP290O15078 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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