Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BCKDKO14874 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BCKDKO14874 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BCKDKO14874 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BCKDKO14874 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BCKDKO14874 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BCKDKO14874 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BCKDKO14874 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BCKDKO14874 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BCKDKO14874 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BCKDKO14874 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BCKDKO14874 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BCKDKO14874 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BCKDKO14874 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BCKDKO14874 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BCKDKO14874 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BCKDKO14874 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BCKDKO14874 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
BCKDKO14874 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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