Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP4-16G5E9R7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms