Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PCH4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PCH4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PCH4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PCH4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PCH4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PCH4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PCH4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PCH4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms