Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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