Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DGG1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DGG1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DGG1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DGG1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms