Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPBD1B2RD01 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPBD1B2RD01 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPBD1B2RD01 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPBD1B2RD01 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPBD1B2RD01 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPBD1B2RD01 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPBD1B2RD01 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPBD1B2RD01 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPBD1B2RD01 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPBD1B2RD01 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPBD1B2RD01 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPBD1B2RD01 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPBD1B2RD01 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPBD1B2RD01 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPBD1B2RD01 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPBD1B2RD01 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CENPBD1B2RD01 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms