Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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