Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SATB2Q9UPW6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms