Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAK1Q9UPV9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms