Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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