Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAI1Q9UI46 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAI1Q9UI46 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms