Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DKK4Q9UBT3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms