Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPS29Q9UBQ0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms