Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFA13Q9P0J0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFA13Q9P0J0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFA13Q9P0J0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFA13Q9P0J0 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFA13Q9P0J0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFA13Q9P0J0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFA13Q9P0J0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms