Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms