Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms