Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP74Q9C0B2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP74Q9C0B2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP74Q9C0B2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP74Q9C0B2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP74Q9C0B2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP74Q9C0B2 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms