Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms