Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms