Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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IFT27Q9BW83 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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IFT27Q9BW83 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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IFT27Q9BW83 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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IFT27Q9BW83 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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IFT27Q9BW83 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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