Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIOK2Q9BVS4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms