Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM43Q9BTV4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms