Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms