Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX2Q9BQ50 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms