Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX2Q99697 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PITX2Q99697 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms