Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms